根据河南省人力资源和社会保障厅〔2011〕第14号文件精神，平顶山市农业科学院被河南省人力资源和社会保障厅批准为河南省第二批博士后研发基地（目前平顶山市有5家省博士后研发基地，市农业科学院是唯一一家农业类博士后研发基地）。
博士后研发基地建设的主要目标和研发方向
主要目标：3-5年内引进博士等高层次科研人才8-10人，把研发基地建成以韭菜研究为龙头，农、林、牧、菜多学科协调发展、国内学科领先的创新型科技团队。组织实施国家、省、市重大农业科技项目3-5项，完成并获得省以上科技成果奖2-3项。培育具有重大应用前景和自主知识产权的突破性优良新品种2-3个，通过示范推广创造显著的社会经济效益。
主要研发方向：一是开展韭菜育种研究。保持平顶山市农业科学院在韭菜研究领域内的领先地位。主要开展韭菜多基因聚合育种技术研究，选育抗虫韭菜新品种。二是开展主要农作物育种研究，提高粮食生产能力。开展小麦、玉米等主要农作物新品种选育，为粮食生产提供优质高产新品种。三是开展农产品加工研究，提高农业附加值和经济效益。主要开展：韭籽生物活性物质提取及加工工艺研究；优质蔬菜深加工技术研究。研发出韭籽加工产品2-3个、蔬菜深加工产品2-3个。
目前工作进展：市政府46次常务会议会专题研究了我院关于“省博士后研发基地建设”的请示，同意引进博士等高层次专业技术人才8—10人到博士后研发基地工作，人员编制报市编办审定；博士后研发基地专项经费按每人5万元纳入财政预算，据实解决；为解决博士后等高层次人才安居问题，同意筹建博士公寓1栋。依托“河南省博士后研发基地”，“韭籽深加工技术研究及产业化”项目与河南省农业科学院顺利对接，引进博士3名，该项目已列入省博管办2012年第一批研发合作项目，按计划正常开展。